Kατά του πιστοποιητικού εμβολιασμού  τάσσεται η ρωσική Εκκλησία εκτιμώντας οτι αυτό ενδέχεται να περιορίσει τα δικαιώματα και τις ελευθερίες των ανθρώπων.

«Υπάρχουν επί του παρόντος περισσότερες ερωτήσεις παρά απαντήσεις, και ως εκ τούτου οι ανησυχίες που εκφράζονται σε σχέση με αυτές τις προτάσεις είναι απόλυτα βάσιμες», δήλωσε ο επικεφαλής του Συνοδικού Τμήματος Εξωτερικών Εκκλησιαστικών Σχέσεων, του Πατριαρχείου Μόσχας, Μητροπολίτης Βολοκολάμσκ κ. Ιλαρίων. Μιλώντας στο τηλεοπτικό κανάλι Rossiya-24 ο Ιεράρχης της Ρωσικής Ορθόδοξης Εκκλησίας είπε ότι ένα τέτοιο διαβατήριο θα παραβίαζε την αρχή περί μη υποχρεωτικού εμβολιασμού την οποία στηρίζουν οι περισσότερες χώρες, συμπεριλαμβανομένων των ευρωπαϊκών.
Ο Μητροπολίτης υποστήριξε επίσης ότι η εισαγωγή τέτοιων πιστοποιητικών μπορεί να βλάψει σοβαρά μερικούς ανθρώπους, για παράδειγμα, εκείνους που δεν μπορούν να εμβολιαστούν για κάποιους. Επεσήμανε επίσης ότι δημιουργούνται διαφορετικά εμβόλια σε διαφορετικές χώρες και ότι δεν θα υπάρχει ούτε ένα εμβόλιο που θα αναγνωρίζεται παγκοσμίως. «Κατά συνέπεια, αυτά τα διαβατήρια εμβολιασμού θα περιλαμβάνουν εμβόλια ή θα περιλαμβάνουν μόνο εμβόλια που αναγνωρίζονται στην επικράτεια της Ευρωπαϊκής Ένωσης;» τόνισε.